蛋白磷酸化研究的预制胶
SuperSep Phos-tag™
SuperSep Phos-tag™ 是研究蛋白磷酸化的方法,无需特异性磷酸化抗体或者同位素标记。
◆SuperSep Phos-tag™
Phos-tag™ 是一种预制胶,预先加入了 50 μmol/L 的 Phostag™ Acrylamide,打开包装即可直接使用。预制胶中含有锌作为金属离子,在中心凝胶缓冲液中保存稳定性很好,得到的带条结果也很整齐。
磷酸化蛋白和非磷酸化蛋白作为不同条带分离。
分离后,胶可用于考马斯亮蓝染色,免疫印迹和质谱实验。
◆Phos-tag™ SDS-PAGE 的原理
◆在 HighWire Search 上搜索到的论文数
◆运用
利用 p35 的丙氨酸突变体确定 Cdk5 激活 p35 的磷酸化位点
p35 常见的磷酸化位点是 Ser8 和 Thr138。但是 Ser8 和 Thr138 位点往往会发生丙氨酸突变,产生3种突变体(Ser8 突变体:S8A,Thr138 突变体:T138A,Ser8 和 Thr138 双突变体:2A)。这3种突变体、野生型 p35、Cdk5 和没有激酶活性的 Cdk5 都来源于 COS-7 细胞。这些细胞裂解液用Phos-tag™ SDS-PAGE 和 Western blotting 进行检测(检测抗体:p35 抗体)。
100 μM Phos-tag ™ 丙烯酰胺, 7.5% 聚丙烯酰胺凝胶
可明确磷酸化位点和条带迁移率的关系!
- 泳道1(条带 L2 和 L4)和泳道5(条带 M1):p35 在 Cdk5 的作用下发生了磷酸化;
- 泳道1(条带 L2 和 L4)和泳道3(条带 L2 和 L4):在无激酶活性 Cdk5 的作用下,大约有一半 p35 蛋白在 Thr138 位点发生磷酸化,同样在 138 位发生突变的 p35 蛋白亦是如此。
- 泳道5 (条带 M1)和泳道6(条带 L3 和 L4):Ser8 和 Thr138 是主要的磷酸化位点;
- 泳道5(条带 M1)、泳道7(条带L1和L2)和泳道8(条带M2):条带 M1 是 Ser8 和T hr138 都发生磷酸化的条带;
条带 M2 是只有 Ser8 磷酸化的条带;条带 L1 和 L2 是只有 Thr138 磷酸化的条带。
※ 条带 L1 和 L3 中的X是不确定哪个位点发生磷酸化的条带;
※ 条带L4是非磷酸化的 p35 。
【参考文献】
▪ Quantitative Measurement of in Vivo Phosphorylation States of Cdk5 Activator p35 by Phos-tag ™ SDS-PAGE. T. Hosokawa, T. Saito, A. Asada, K. Fukunaga, and S. Hisanaga,Mol. Cell. Proteomics, Jun 2010;9: 1133 - 1143.
【结果提供】
理化学研究所 脑科学综合研究中心 回路功能研究核心 记忆功能研究团队 细川智永(Dr. T. Hosokawa)
首都大学东京 理工学研究科 生命科学专业 神经分子功能研究室 久永真市(Dr. S. Hisanaga)
检测含有 Dnmt1 磷酸化激酶的片段
我们可以确定在片段中含有目的激酶!
① 采用亲和色谱法从鼠脑提取液中纯化 GST-Dnmt1(1-290)结合蛋白
② 使用 0.3 M 和 1 M NaCl 的 DNA 纤维素柱洗脱得到目的蛋白
③ GST-Dnmt1(1-290)作为体外激酶实验的反应底物
④ Phos-tag ™ SDS-PAGE 用于Western blotting,确定迁移条带中每个片段的激酶活性
【参考文献】
The DNA-binding activity of mouse DNA methyltransferase 1 is regulated by phosphorylation with casein kinase 1delta/epsilon. Y. Sugiyama, N. Hatano, N. Sueyoshi, I. Suetake, S. Tajima, E. Kinoshita, E. Kinoshita-Kikuta, T. Koike, and I. Kameshita, Biochem. J., May 2010; 427(3): 489-97.
【结果提供】
高知大学 综合研究中心 生命、功能物质部门 实验实习机器设施 杉山康宪(Dr. Y. Sugiyama)
香川大学 农学部 应用生物科学科 动物功能生化学研究室 龟下勇(Dr. I. Kameshita)
二维电泳中的应用:分析 hnRNP K 磷酸化异构体
小鼠巨噬细胞 J774.1 经 LPS 刺激后,裂解细胞,经过免疫沉淀法分离得到 hnRNP K。在二维电泳中,一维是 IPG 胶,二维是 Phos-tag ™ SDS-PAGE,可分离 hnRNP K 的异构体。利用质谱仪,可以确认不同的点代表不同的亚型或修饰蛋白。
同一个等电点的位置上,不同位点发生磷酸化都可以被区分开来
(例: spots 6 vs. 8 and spots 4 vs. 7)
【参考文献】
▪ Characterization of multiple alternative forms of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K by phosphate-affinity electrophoresis. Y. Kimura, K. Nagata, N Suzuki, R. Yokoyama, Y. Yamanaka, H. Kitamura, H. Hirano, and O. Ohara, Proteomics, Nov 2010; 10(21): 3884-95.
【结果提供】
横滨市立大学 生命纳米系统科学研究科 生物体超分子系统科学专业 木村弥生(Dr. Y. Kimura)、平野久(Dr. H. Hirano)
理化学研究所 RCAI 小原收
◆备注
样品制备:
Phos-tag SDS-PAGE 对于蛋白样品中的杂质非常敏感,尤其是螯合剂,钒酸,无机盐,表面活性剂这类物质。
强烈建议在 Phos-tag SDS-PAGE 之前通过 TCA 沉淀或渗析法降低杂质含量。
转膜前处理:
另一个必须的步骤是在转膜前,用 EDTA 去除凝胶中的金属离子(Mn2+ 或者Zn2+);该步骤可提高蛋白的转膜效率。
● 分别准备 10 mmol/L 含 EDTA 和不含 EDTA 两种 1x transfer buffer。
● 将凝胶浸泡在含 10 mmol/L EDTA 的 1x transfer buffer,至少 20 分钟,温和摇晃。更换新缓冲液,重复3次。
● 将凝胶浸泡在不含 10 mmol/L EDTA 的 1x transfer buffer,10 分钟,温和摇晃。
● 转膜操作*。
* 建议用湿法转膜,以提高转膜效率。
◆质量控制
每一批 SuperSep Phos-tag™,出厂前均根据其产品规格进行测试,以保证可分离磷酸化和非磷酸化蛋白,以及他们的分离成都在正常参数内。
◆保存温度
2-10℃
◆产品信息
用于 Bio-Rad 伯乐电泳仪
货号 | 品名 | 电泳仪 | 规格 |
SuperSep™ Phos-tag™ (50μmol/L), 7.5%, 17well, 83×100×3.9mm | Mini-PROTEAN® Tetra Cell (Bio-Rad Laboratories, Inc.) | 5 块 | |
SuperSep™ Phos-tag™ (50μmol/L), 12.5%, 17well, 83×100×3.9mm | 5 块 |
用于 Life Technologies 电泳仪
货号 | 品名 | 电泳仪 | 规格 |
SuperSep™ Phos-tag™ (50μmol/L), 7.5%, 17well, 100×100×6.6mm | XCell SureLock® Mini-Cell (Life Technologies, Inc.) | 5 块 | |
SuperSep™ Phos-tag™ (50μmol/L), 12.5%, 17well, 100×100×6.6mm | 5 块 |
用于 Wako EasySeperator 电泳仪
产品编号 | 产品 | 凝胶浓度 | 孔数 | 包装 |
192-17401 | SuperSep™ Phos-tag™ (50 μmol/L) Phos-tag™ 预制胶50 μmol/L | 6.0% | 13孔 | 5块 |
199-17391 | 6.0% | 17孔 | 5块 | |
195-17371 | 7.5% | 13孔 | 5块 | |
192-17381 | 7.5% | 17孔 | 5块 | |
193-16711 | 10.0% | 13孔 | 5块 | |
190-16721 | 10.0% | 17孔 | 5块 | |
195-16391 | 12.5% | 13孔 | 5块 | |
193-16571 | 12.5% | 17孔 | 5块 | |
193-16691 | 15.0% | 13孔 | 5块 | |
196-16701 | 15.0% | 17孔 | 5块 | |
197-16851 | 17.5% | 13孔 | 5块 | |
194-16861 | 17.5% | 17孔 | 5块 |
◆相关产品
产品编号 | 产品名称 | 规格 |
058-07681 | EasySeparator Phos-tag预制凝胶的配套电泳槽 | 1 set |
SuperSep Phos-tag™ 预制胶
SuperSep Phos-tag™
蛋白磷酸化研究的预制胶
SuperSep Phos-tag™
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Phos-tag™ 是一种预制胶,预先加入了 50 μmol/L 的 Phostag™ Acrylamide,打开包装即可直接使用。预制胶中含有锌作为金属离子,在中心凝胶缓冲液中保存稳定性很好,得到的带条结果也很整齐。
磷酸化蛋白和非磷酸化蛋白作为不同条带分离。
分离后,胶可用于考马斯亮蓝染色,免疫印迹和质谱实验。
◆Phos-tag™ SDS-PAGE 的原理
◆在 HighWire Search 上搜索到的论文数
◆运用
利用 p35 的丙氨酸突变体确定 Cdk5 激活 p35 的磷酸化位点
p35 常见的磷酸化位点是 Ser8 和 Thr138。但是 Ser8 和 Thr138 位点往往会发生丙氨酸突变,产生3种突变体(Ser8 突变体:S8A,Thr138 突变体:T138A,Ser8 和 Thr138 双突变体:2A)。这3种突变体、野生型 p35、Cdk5 和没有激酶活性的 Cdk5 都来源于 COS-7 细胞。这些细胞裂解液用Phos-tag™ SDS-PAGE 和 Western blotting 进行检测(检测抗体:p35 抗体)。
100 μM Phos-tag ™ 丙烯酰胺, 7.5% 聚丙烯酰胺凝胶
可明确磷酸化位点和条带迁移率的关系!
- 泳道1(条带 L2 和 L4)和泳道5(条带 M1):p35 在 Cdk5 的作用下发生了磷酸化;
- 泳道1(条带 L2 和 L4)和泳道3(条带 L2 和 L4):在无激酶活性 Cdk5 的作用下,大约有一半 p35 蛋白在 Thr138 位点发生磷酸化,同样在 138 位发生突变的 p35 蛋白亦是如此。
- 泳道5 (条带 M1)和泳道6(条带 L3 和 L4):Ser8 和 Thr138 是主要的磷酸化位点;
- 泳道5(条带 M1)、泳道7(条带L1和L2)和泳道8(条带M2):条带 M1 是 Ser8 和T hr138 都发生磷酸化的条带;
条带 M2 是只有 Ser8 磷酸化的条带;条带 L1 和 L2 是只有 Thr138 磷酸化的条带。
※ 条带 L1 和 L3 中的X是不确定哪个位点发生磷酸化的条带;
※ 条带L4是非磷酸化的 p35 。
【参考文献】
▪ Quantitative Measurement of in Vivo Phosphorylation States of Cdk5 Activator p35 by Phos-tag ™ SDS-PAGE. T. Hosokawa, T. Saito, A. Asada, K. Fukunaga, and S. Hisanaga,Mol. Cell. Proteomics, Jun 2010;9: 1133 - 1143.
【结果提供】
理化学研究所 脑科学综合研究中心 回路功能研究核心 记忆功能研究团队 细川智永(Dr. T. Hosokawa)
首都大学东京 理工学研究科 生命科学专业 神经分子功能研究室 久永真市(Dr. S. Hisanaga)
检测含有 Dnmt1 磷酸化激酶的片段
我们可以确定在片段中含有目的激酶!
① 采用亲和色谱法从鼠脑提取液中纯化 GST-Dnmt1(1-290)结合蛋白
② 使用 0.3 M 和 1 M NaCl 的 DNA 纤维素柱洗脱得到目的蛋白
③ GST-Dnmt1(1-290)作为体外激酶实验的反应底物
④ Phos-tag ™ SDS-PAGE 用于Western blotting,确定迁移条带中每个片段的激酶活性
【参考文献】
The DNA-binding activity of mouse DNA methyltransferase 1 is regulated by phosphorylation with casein kinase 1delta/epsilon. Y. Sugiyama, N. Hatano, N. Sueyoshi, I. Suetake, S. Tajima, E. Kinoshita, E. Kinoshita-Kikuta, T. Koike, and I. Kameshita, Biochem. J., May 2010; 427(3): 489-97.
【结果提供】
高知大学 综合研究中心 生命、功能物质部门 实验实习机器设施 杉山康宪(Dr. Y. Sugiyama)
香川大学 农学部 应用生物科学科 动物功能生化学研究室 龟下勇(Dr. I. Kameshita)
二维电泳中的应用:分析 hnRNP K 磷酸化异构体
小鼠巨噬细胞 J774.1 经 LPS 刺激后,裂解细胞,经过免疫沉淀法分离得到 hnRNP K。在二维电泳中,一维是 IPG 胶,二维是 Phos-tag ™ SDS-PAGE,可分离 hnRNP K 的异构体。利用质谱仪,可以确认不同的点代表不同的亚型或修饰蛋白。
同一个等电点的位置上,不同位点发生磷酸化都可以被区分开来
(例: spots 6 vs. 8 and spots 4 vs. 7)
【参考文献】
▪ Characterization of multiple alternative forms of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K by phosphate-affinity electrophoresis. Y. Kimura, K. Nagata, N Suzuki, R. Yokoyama, Y. Yamanaka, H. Kitamura, H. Hirano, and O. Ohara, Proteomics, Nov 2010; 10(21): 3884-95.
【结果提供】
横滨市立大学 生命纳米系统科学研究科 生物体超分子系统科学专业 木村弥生(Dr. Y. Kimura)、平野久(Dr. H. Hirano)
理化学研究所 RCAI 小原收
◆备注
样品制备:
Phos-tag SDS-PAGE 对于蛋白样品中的杂质非常敏感,尤其是螯合剂,钒酸,无机盐,表面活性剂这类物质。
强烈建议在 Phos-tag SDS-PAGE 之前通过 TCA 沉淀或渗析法降低杂质含量。
转膜前处理:
另一个必须的步骤是在转膜前,用 EDTA 去除凝胶中的金属离子(Mn2+ 或者Zn2+);该步骤可提高蛋白的转膜效率。
● 分别准备 10 mmol/L 含 EDTA 和不含 EDTA 两种 1x transfer buffer。
● 将凝胶浸泡在含 10 mmol/L EDTA 的 1x transfer buffer,至少 20 分钟,温和摇晃。更换新缓冲液,重复3次。
● 将凝胶浸泡在不含 10 mmol/L EDTA 的 1x transfer buffer,10 分钟,温和摇晃。
● 转膜操作*。
* 建议用湿法转膜,以提高转膜效率。
◆质量控制
每一批 SuperSep Phos-tag™,出厂前均根据其产品规格进行测试,以保证可分离磷酸化和非磷酸化蛋白,以及他们的分离成都在正常参数内。
◆保存温度
2-10℃
◆产品信息
用于 Bio-Rad 伯乐电泳仪
货号 | 品名 | 电泳仪 | 规格 |
SuperSep™ Phos-tag™ (50μmol/L), 7.5%, 17well, 83×100×3.9mm | Mini-PROTEAN® Tetra Cell (Bio-Rad Laboratories, Inc.) | 5 块 | |
SuperSep™ Phos-tag™ (50μmol/L), 12.5%, 17well, 83×100×3.9mm | 5 块 |
用于 Life Technologies 电泳仪
货号 | 品名 | 电泳仪 | 规格 |
SuperSep™ Phos-tag™ (50μmol/L), 7.5%, 17well, 100×100×6.6mm | XCell SureLock® Mini-Cell (Life Technologies, Inc.) | 5 块 | |
SuperSep™ Phos-tag™ (50μmol/L), 12.5%, 17well, 100×100×6.6mm | 5 块 |
用于 Wako EasySeperator 电泳仪
产品编号 | 产品 | 凝胶浓度 | 孔数 | 包装 |
192-17401 | SuperSep™ Phos-tag™ (50 μmol/L) Phos-tag™ 预制胶50 μmol/L | 6.0% | 13孔 | 5块 |
199-17391 | 6.0% | 17孔 | 5块 | |
195-17371 | 7.5% | 13孔 | 5块 | |
192-17381 | 7.5% | 17孔 | 5块 | |
193-16711 | 10.0% | 13孔 | 5块 | |
190-16721 | 10.0% | 17孔 | 5块 | |
195-16391 | 12.5% | 13孔 | 5块 | |
193-16571 | 12.5% | 17孔 | 5块 | |
193-16691 | 15.0% | 13孔 | 5块 | |
196-16701 | 15.0% | 17孔 | 5块 | |
197-16851 | 17.5% | 13孔 | 5块 | |
194-16861 | 17.5% | 17孔 | 5块 |
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195-16391 | SuperSep Phos-tag™ (50 μmol/L), 12.5%, 13 well Phos-tag 13孔12.5%预制胶 | 5块 | - |
193-16571 | SuperSep Phos-tag™ (50 μmol/L), 12.5%, 17 well Phos-tag 17孔12.5%预制胶 | 5块 | - |
193-16691 | SuperSep Phos-tag™ (50 μmol/L), 15%, 13 well Phos-tag 13孔15%预制胶 | 5块 | - |
196-16701 | SuperSep Phos-tag™ (50 μmol/L), 15%, 17 well Phos-tag 17孔15%预制胶 | 5块 | - |
197-16851 | SuperSep Phos-tag™ (50 μmol/L), 17.5%, 13 well Phos-tag 13孔17.5%预制胶 | 5块 | - |
194-16861 | SuperSep Phos-tag™ (50 μmol/L), 17.5%, 17 well Phos-tag 17孔17.5%预制胶 | 5块 | - |